Homo sapiens Gene: OGDH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-15045.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | OGDH | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | oxoglutarate (alpha-ketoglutarate) dehydrogenase (lipoamide) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | AKGDH; E1k; OGDC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000105953 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
oxoglutarate (alpha-ketoglutarate) dehydrogenase (lipoamide)
oxoglutarate (alpha-ketoglutarate) dehydrogenase (lipoamide)
oxoglutarate (alpha-ketoglutarate) dehydrogenase (lipoamide)
oxoglutarate (alpha-ketoglutarate) dehydrogenase (lipoamide)
oxoglutarate (alpha-ketoglutarate) dehydrogenase (lipoamide)
oxoglutarate (alpha-ketoglutarate) dehydrogenase (lipoamide)
oxoglutarate (alpha-ketoglutarate) dehydrogenase (lipoamide)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes one subunit of the 2-oxoglutarate dehydrogenase complex. This complex catalyzes the overall conversion of 2-oxoglutarate (alpha-ketoglutarate) to succinyl-CoA and CO(2) during the Krebs cycle. The protein is located in the mitochondrial matrix and uses thiamine pyrophosphate as a cofactor. A congenital deficiency in 2-oxoglutarate dehydrogenase activity is believed to lead to hypotonia, metabolic acidosis, and hyperlactatemia. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding distinct isoforms.[provided by RefSeq, Sep 2009] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 7:44606572-44709066 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | p13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 25 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Lysine catabolism pathway
Citric acid cycle (TCA cycle) pathway
Pyruvate metabolism and Citric Acid (TCA) cycle pathway
Metabolism of amino acids and derivatives pathway
The citric acid (TCA) cycle and respiratory electron transport pathway
Metabolism pathway
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KEGG |
Citrate cycle (TCA cycle) pathway
Tryptophan metabolism pathway
Lysine degradation pathway
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INOH |
Citrate cycle pathway
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PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.488181 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001003941 NM_001165036 NM_002541 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS34627 CCDS47580 CCDS55107 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 08938 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||