Mus musculus Gene: Ogdh | |||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-146734.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Ogdh | ||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | oxoglutarate dehydrogenase (lipoamide) | ||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 2210403E04Rik; 2210412K19Rik; AA409584; d1401; mKIAA4192 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000020456 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
oxoglutarate dehydrogenase (lipoamide)
oxoglutarate dehydrogenase (lipoamide)
oxoglutarate dehydrogenase (lipoamide)
oxoglutarate dehydrogenase (lipoamide)
oxoglutarate dehydrogenase (lipoamide)
oxoglutarate dehydrogenase (lipoamide)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000105953:
This gene encodes one subunit of the 2-oxoglutarate dehydrogenase complex. This complex catalyzes the overall conversion of 2-oxoglutarate (alpha-ketoglutarate) to succinyl-CoA and CO(2) during the Krebs cycle. The protein is located in the mitochondrial matrix and uses thiamine pyrophosphate as a cofactor. A congenital deficiency in 2-oxoglutarate dehydrogenase activity is believed to lead to hypotonia, metabolic acidosis, and hyperlactatemia. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding distinct isoforms.[provided by RefSeq, Sep 2009] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 11:6291633-6356642 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||
Band | A1 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 13 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 21 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
The citric acid (TCA) cycle and respiratory electron transport pathway
Metabolism pathway
Metabolism of amino acids and derivatives pathway
Pyruvate metabolism and Citric Acid (TCA) cycle pathway
Lysine catabolism pathway
Citric acid cycle (TCA cycle) pathway
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KEGG |
Lysine degradation pathway
Citrate cycle (TCA cycle) pathway
Tryptophan metabolism pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Lysine catabolism pathway
Citric acid cycle (TCA cycle) pathway
Pyruvate metabolism and Citric Acid (TCA) cycle pathway
Metabolism of amino acids and derivatives pathway
The citric acid (TCA) cycle and respiratory electron transport pathway
Metabolism pathway
Metabolism of amino acids and derivatives pathway
Lysine catabolism pathway
The citric acid (TCA) cycle and respiratory electron transport pathway
Metabolism pathway
Pyruvate metabolism and Citric Acid (TCA) cycle pathway
Citric acid cycle (TCA cycle) pathway
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KEGG |
Citrate cycle (TCA cycle) pathway
Tryptophan metabolism pathway
Lysine degradation pathway
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INOH |
Citrate cycle pathway
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PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.472458 Mm.490272 | ||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001252282 NM_001252283 NM_001252287 NM_001252288 NM_010956 XM_006514582 XM_006514583 XM_006514584 XM_006514585 XM_006514586 | ||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS36106 CCDS56758 CCDS56759 | ||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||