Mus musculus Gene: Ranbp1 | |||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-141228.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Ranbp1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | RAN binding protein 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | Htf9a | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000005732 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
RAN binding protein 1
RAN binding protein 1
|
||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000099901:
Ran/TC4-binding protein, RanBP1, interacts specifically with GTP-charged RAN. RANBP1 encodes a 23-kD protein that binds to RAN complexed with GTP but not GDP. RANBP1 does not activate GTPase activity of RAN but does markedly increase GTP hydrolysis by the RanGTPase-activating protein (RanGAP1). The RANBP1 cDNA encodes a 201-amino acid protein that is 92% similar to its mouse homolog. In both mammalian cells and in yeast, RANBP1 acts as a negative regulator of RCC1 by inhibiting RCC1-stimulated guanine nucleotide release from RAN. [provided by RefSeq, Jul 2008] This gene encodes a protein that forms a complex with Ras-related nuclear protein (Ran) and metabolizes guanoside triphosphate (GTP). This complex participates in the regulation of the cell cycle by controlling transport of proteins and nucleic acids into the nucleus. There are multiple pseudogenes for this gene on chromosomes 9, 12, 17, and X. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jul 2013] |
||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 16:18239784-18248732 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | A3 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
|
||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 4 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 24 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
|
Gene ID
Gene Order
|
||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Rev-mediated nuclear export of HIV RNA pathway
Late Phase of HIV Life Cycle pathway
HIV Life Cycle pathway
HIV Infection pathway
Host Interactions of HIV factors pathway
Interactions of Rev with host cellular proteins pathway
Disease pathway
|
||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI |
E2F transcription factor network
|
||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.235287 Mm.367034 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_011239 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS37280 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||