Homo sapiens Protein: TRAF6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-40104.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | TRAF6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | TNF receptor-associated factor 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | MGC:3310; RNF85; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000337853 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-40102 (TRAF6) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | E3 ubiquitin ligase that, together with UBE2N and UBE2V1, mediates the synthesis of 'Lys-63'-linked-polyubiquitin chains conjugated to proteins, such as IKBKG, IRAK1, AKT1 and AKT2. Also mediates ubiquitination of free/unanchored polyubiquitin chain that leads to MAP3K7 activation. Leads to the activation of NF-kappa-B and JUN. May be essential for the formation of functional osteoclasts. Seems to also play a role in dendritic cells (DCs) maturation and/or activation. Represses c- Myb-mediated transactivation, in B-lymphocytes. Adapter protein that seems to play a role in signal transduction initiated via TNF receptor, IL-1 receptor and IL-17 receptor. Regulates osteoclast differentiation by mediating the activation of adapter protein complex 1 (AP-1) and NF-kappa-B, in response to RANK-L stimulation. Together with MAP3K8, mediates CD40 signals that activate ERK in B-cells and macrophages, and thus may play a role in the regulation of immunoglobulin production. {ECO:0000269PubMed:11057907, ECO:0000269PubMed:12140561, ECO:0000269PubMed:16378096, ECO:0000269PubMed:17135271, ECO:0000269PubMed:18093978, ECO:0000269PubMed:18347055, ECO:0000269PubMed:18758450, ECO:0000269PubMed:19465916, ECO:0000269PubMed:19675569, ECO:0000269PubMed:19713527, ECO:0000269PubMed:8837778}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cytoplasm {ECO:0000269PubMed:18093978}. Cytoplasm, cell cortex {ECO:0000269PubMed:18093978}. Nucleus {ECO:0000269PubMed:18093978}. Lipid droplet {ECO:0000250}. Note=Found in the nuclei of some aggressive B-cell lymphoma cell lines as well as in the nuclei of both resting and activated T- and B-lymphocytes. Found in punctate nuclear body protein complexes. Ubiquitination may occur in the cytoplasm and sumoylation in the nucleus. RSAD2/viperin recruits it to the lipid droplet (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Expressed in heart, brain, placenta, lung, liver, skeletal muscle, kidney and pancreas. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 398 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 95 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001293
Zinc finger, TRAF-type IPR001841 Zinc finger, RING-type IPR002083 MATH IPR008974 TRAF-like IPR012227 TNF receptor-associated factor TRAF IPR018957 Zinc finger, C3HC4 RING-type |
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PFAM |
PF13639
PF14634 PF00917 PF00097 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PIRSF |
PIRSF015614
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SMART |
SM00184
SM00061 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q9Y4K3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q9Y4K3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 7189 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.444172 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_665802 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:12036 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 602355 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS7901 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 03833 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC009656 AC061999 AK292978 AY228337 BC031052 CH471064 U78798 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAB38751 AAH31052 AAO38054 BAF85667 EAW68119 EAW68120 EAW68122 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||