Mus musculus Protein: Vsx2 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-156856.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Vsx2 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | visual system homeobox 2 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | Chx10; Hox-10; Hox10; or; | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000021665 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-156854 (Vsx2) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Plays a significant role in the specification and morphogenesis of the sensory retina. May also participate in the development of the cells of the inner nuclear layer, particularly bipolar cells. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | Note=Defects in Vsx2 are the cause of ocular retardation (OR(J)), a mouse disease characterized by microphthalmia, progressive destruction of the retina, and absence of the optic nerve. The OR(J) mutation is due to an OCHR (STOP) mutation. | ||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Expressed throughout the anterior optic vesicle and all neuroblasts of the optic cup. In the mature retina Is restricted to the inner nuclear layer, in which its expression decreases from the outer to the inner margin. Also detected in regions of the developing thalamus, hindbrain, and ventral spinal cord. | ||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 8 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:88401 | ||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001356
Homeobox domain IPR003654 OAR domain IPR009057 Homeodomain-like |
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PFAM |
PF00046
PF03826 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00389
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q61412 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q61412 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q80WF9 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 12677 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.4405 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_031727 | ||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Vsx2 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS36493 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AK143461 AK162139 BC031869 BC051245 CH466590 L34808 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA60431 AAH31869 AAH51245 BAE25386 BAE36748 EDL02810 | ||||||||||||||||||||||