Homo sapiens Protein: HCN1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-20028.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | HCN1 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | hyperpolarization activated cyclic nucleotide-gated potassium channel 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000307342 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-20026 (HCN1) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Hyperpolarization-activated ion channel exhibiting weak selectivity for potassium over sodium ions. Contributes to the native pacemaker currents in heart (If) and in neurons (Ih). May mediate responses to sour stimuli. {ECO:0000269PubMed:15351778}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cell membrane {ECO:0000269PubMed:15351778}; Multi-pass membrane protein {ECO:0000269PubMed:15351778}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Detected in brain, in particular in amygdala and hippocampus, while expression in caudate nucleus, corpus callosum, substantia nigra, subthalamic nucleus and thalamus is very low or not detectable. Detected at very low levels in muscle and pancreas. {ECO:0000269PubMed:9630217}. | ||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 8 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000595
Cyclic nucleotide-binding domain IPR003938 Potassium channel, voltage-dependent, EAG/ELK/ERG IPR005821 Ion transport domain IPR013621 Ion transport N-terminal IPR018490 Cyclic nucleotide-binding-like |
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PFAM |
PF00027
PF00520 PF08412 |
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PRINTS |
PR01463
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PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00100
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | O60741 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-O60741 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 348980 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.618126 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_066550 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:4845 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 602780 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS3952 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 09099 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AC099514 AC114975 AC117529 AC138520 AF064876 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAC39759 | ||||||||||||||||||||||