Mus musculus Protein: Scarf1 | |||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-200121.6 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | Scarf1 | ||||||||||||||||||
Protein Name | scavenger receptor class F, member 1 | ||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000044248 | ||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-200119 (Scarf1) | ||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||
Function | Mediates the binding and degradation of acetylated low density lipoprotein (Ac-LDL). Mediates heterophilic interactions, suggesting a function as adhesion protein (By similarity). Plays a role in the regulation of neurite-like outgrowth. {ECO:0000250, ECO:0000269PubMed:15247299}. | ||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Membrane {ECO:0000305}; Single-pass type I membrane protein {ECO:0000305}. | ||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Expressed weakly in brain, spinal cord and dorsal root ganglions. {ECO:0000269PubMed:15247299}. | ||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:2449455 | ||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000742
Epidermal growth factor-like domain IPR002049 EGF-like, laminin IPR009030 Insulin-like growth factor binding protein, N-terminal |
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PFAM |
PF00008
PF00053 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||
SMART |
SM00181
SM00180 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | Q5ND28 | ||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q5ND28 | ||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | 380713 | ||||||||||||||||||
UniGene | Mm.10486 | ||||||||||||||||||
RefSeq | NP_001004157 | ||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||
MGI Symbol | Scarf1 | ||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||
CCDS | CCDS25050 | ||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | AK133477 AK220215 AL591496 | ||||||||||||||||||
GenPept | BAD90140 BAE21676 CAI35389 | ||||||||||||||||||