Homo sapiens Gene: BRPF1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-15675.5 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | BRPF1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | bromodomain and PHD finger containing, 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | BR140 | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000156983 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
bromodomain and PHD finger containing, 1
bromodomain and PHD finger containing, 1
bromodomain and PHD finger containing, 1
bromodomain and PHD finger containing, 1
bromodomain and PHD finger containing, 1
bromodomain and PHD finger containing, 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene is expressed ubiquitously and at the highest level in testes and spermatogonia. The protein is localized within nuclei, and it is very similar in structure to two zinc finger proteins, AF10 and AF17. It is suggested that these proteins form a family of regulatory proteins. Two alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 3:9731729-9748018 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | p25.3 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 12 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
HATs acetylate histones pathway
Chromatin organization pathway
Chromatin modifying enzymes pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.1004 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001003694 NM_004634 XM_005265450 XM_005265451 XM_005265452 XM_005265453 XM_005265454 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS2575 CCDS33692 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 03875 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||