Bos taurus Gene: APOBEC1 | |||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-639768.3 | ||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||
Gene Symbol | APOBEC1 | ||||||||||||||||||||
Gene Name | Uncharacterized protein | ||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000014683 | ||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
apolipoprotein B mRNA editing enzyme, catalytic polypeptide 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000111701:
This gene encodes a member of the cytidine deaminase enzyme family. The encoded protein forms a multiple-protein editing holoenzyme with APOBEC1 complementation factor (ACF) and APOBEC1 stimulating protein (ASP). This holoenzyme is involved in the editing of C-to-U nucleotide bases in apolipoprotein B and neurofibromatosis-1 mRNAs. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 5:101725366-101730873 | ||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 6 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||
REACTOME |
Formation of the Editosome pathway
mRNA Editing: C to U Conversion pathway
mRNA Editing pathway
Gene Expression pathway
Formation of the Editosome pathway
mRNA Editing: C to U Conversion pathway
Gene Expression pathway
mRNA Editing pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.63664 | ||||||||||||||||||||
RefSeq | XM_002687817 XM_594173 | ||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||