Homo sapiens Gene: APOBEC1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-16344.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | APOBEC1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | apolipoprotein B mRNA editing enzyme, catalytic polypeptide 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | APOBEC-1; BEDP; CDAR1; HEPR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000111701 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
apolipoprotein B mRNA editing enzyme, catalytic polypeptide 1
apolipoprotein B mRNA editing enzyme, catalytic polypeptide 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a member of the cytidine deaminase enzyme family. The encoded protein forms a multiple-protein editing holoenzyme with APOBEC1 complementation factor (ACF) and APOBEC1 stimulating protein (ASP). This holoenzyme is involved in the editing of C-to-U nucleotide bases in apolipoprotein B and neurofibromatosis-1 mRNAs. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 12:7649400-7665903 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | p13.31 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 9 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Formation of the Editosome pathway
mRNA Editing: C to U Conversion pathway
mRNA Editing pathway
Gene Expression pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 339 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.560 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | XM_005253356 NM_001644 XM_005253355 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:604 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 600130 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS8579 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 02531 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 339 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||