Mus musculus Gene: Kdm5a | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-183502.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Kdm5a | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | lysine (K)-specific demethylase 5A | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000030180 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
lysine (K)-specific demethylase 5A
lysine (K)-specific demethylase 5A
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000073614:
The protein encoded by this gene is a ubiquitously expressed nuclear protein. It binds directly, with several other proteins, to retinoblastoma protein which regulates cell proliferation. This protein also interacts with rhombotin-2 which functions distinctly in erythropoiesis and in T-cell leukemogenesis. Rhombotin-2 is thought to either directly affect the activity of the encoded protein or may indirectly modulate the functions of the retinoblastoma protein by binding to this protein. [provided by RefSeq, Mar 2010] This gene encodes a member of the Jumonji, AT-rich interactive domain 1 (JARID1) histone demethylase protein family. The encoded protein plays a role in gene regulation through the histone code by specifically demethylating lysine 4 of histone H3. The encoded protein interacts with many other proteins, including retinoblastoma protein, and is implicated in the transcriptional regulation of Hox genes and cytokines. This gene may play a role in tumor progression. [provided by RefSeq, Aug 2013] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 6:120364099-120444574 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | F1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 21 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Chromatin organization pathway
HDMs demethylate histones pathway
Chromatin modifying enzymes pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
HDMs demethylate histones pathway
Chromatin organization pathway
Chromatin modifying enzymes pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.404761 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_145997 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS51889 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||