Homo sapiens Protein: SF3A1 | |||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-4043.5 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | SF3A1 | ||||||||||||||||||
Protein Name | splicing factor 3a, subunit 1, 120kDa | ||||||||||||||||||
Synonyms | PRP21; PRPF21; SAP114; SF3A120; | ||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000215793 | ||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-4041 (SF3A1) | ||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||
Function | Subunit of the splicing factor SF3A required for 'A' complex assembly formed by the stable binding of U2 snRNP to the branchpoint sequence (BPS) in pre-mRNA. Sequence independent binding of SF3A/SF3B complex upstream of the branch site is essential, it may anchor U2 snRNP to the pre-mRNA. May also be involved in the assembly of the 'E' complex. | ||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Ubiquitously expressed. | ||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 149 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000061
SWAP/Surp IPR000626 Ubiquitin-like IPR022030 Pre-mRNA splicing factor PRP21-like protein IPR029071 Ubiquitin-related domain |
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PFAM |
PF01805
PF00240 PF14560 PF12230 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||
SMART |
SM00648
SM00213 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | Q15459 | ||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q15459 | ||||||||||||||||||
TrEMBL | A0A024R1K8 | ||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | 10291 | ||||||||||||||||||
UniGene | Hs.626979 | ||||||||||||||||||
RefSeq | NP_005868 | ||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:10765 | ||||||||||||||||||
OMIM | 605595 | ||||||||||||||||||
CCDS | CCDS13875 | ||||||||||||||||||
HPRD | 06903 | ||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | AC004997 BC001976 BC007684 CH471095 CR456575 X85237 | ||||||||||||||||||
GenPept | AAC23435 AAH01976 AAH07684 CAA59494 CAG30461 EAW59878 EAW59879 | ||||||||||||||||||