Version 5.4
| Homo sapiens Protein: KDM5D | |||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Summary | |||||||||||||||||||
| InnateDB Protein | IDBP-360.7 | ||||||||||||||||||
| Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
| Gene Symbol | KDM5D | ||||||||||||||||||
| Protein Name | lysine (K)-specific demethylase 5D | ||||||||||||||||||
| Synonyms | |||||||||||||||||||
| Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
| Ensembl Protein | ENSP00000372256 | ||||||||||||||||||
| InnateDB Gene | IDBG-354 (KDM5D) | ||||||||||||||||||
| Protein Structure |
|
||||||||||||||||||
| UniProt Annotation | |||||||||||||||||||
| Function | Histone demethylase that specifically demethylates 'Lys- 4' of histone H3, thereby playing a central role in histone code. Does not demethylate histone H3 'Lys-9', H3 'Lys-27', H3 'Lys-36', H3 'Lys-79' or H4 'Lys-20'. Demethylates trimethylated and dimethylated but not monomethylated H3 'Lys-4'. May play a role in spermatogenesis. {ECO:0000269PubMed:17320160, ECO:0000269PubMed:17320162, ECO:0000269PubMed:17351630}. | ||||||||||||||||||
| Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000305}. | ||||||||||||||||||
| Disease Associations | |||||||||||||||||||
| Tissue Specificity | |||||||||||||||||||
| Comments | |||||||||||||||||||
| Interactions | |||||||||||||||||||
| Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 7 experimentally validated interaction(s) in this database.
|
||||||||||||||||||
| Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||
| Biological Process |
|
||||||||||||||||||
| Cellular Component |
|
||||||||||||||||||
| Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||
| PDB ID | |||||||||||||||||||
| InterPro |
IPR001606
ARID/BRIGHT DNA-binding domain IPR001965 Zinc finger, PHD-type IPR003347 JmjC domain IPR003349 Transcription factor jumonji, JmjN IPR004198 Zinc finger, C5HC2-type IPR011011 Zinc finger, FYVE/PHD-type IPR013637 Lysine-specific demethylase-like domain IPR019787 Zinc finger, PHD-finger |
||||||||||||||||||
| PFAM |
PF01388
PF02373 PF08007 PF02375 PF02928 PF08429 PF00628 |
||||||||||||||||||
| PRINTS | |||||||||||||||||||
| PIRSF | |||||||||||||||||||
| SMART |
SM00501
SM00249 SM00558 SM00545 |
||||||||||||||||||
| TIGRFAMs | |||||||||||||||||||
| Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||
| Modification | |||||||||||||||||||
| Cross-References | |||||||||||||||||||
| SwissProt | Q9BY66 | ||||||||||||||||||
| PhosphoSite | PhosphoSite-Q9BY66 | ||||||||||||||||||
| TrEMBL | |||||||||||||||||||
| UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
| Entrez Gene | 8284 | ||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.80358 | ||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_001140178 | ||||||||||||||||||
| HUGO | HGNC:11115 | ||||||||||||||||||
| OMIM | 426000 | ||||||||||||||||||
| CCDS | CCDS55554 | ||||||||||||||||||
| HPRD | 02464 | ||||||||||||||||||
| IMGT | |||||||||||||||||||
| EMBL | AC010889 AF134849 AF273841 BC132721 BC144102 BC146767 CH471202 D87072 U52191 U52365 | ||||||||||||||||||
| GenPept | AAC50806 AAC51135 AAG00951 AAI32722 AAI44103 AAI46768 AAK27839 BAA13241 EAW54663 | ||||||||||||||||||