Homo sapiens Gene: LIMK1 | |||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-20945.6 | ||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | LIMK1 | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | LIM domain kinase 1 | ||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | LIMK; LIMK-1 | ||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000106683 | ||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
LIM domain kinase 1
LIM domain kinase 1
LIM domain kinase 1
LIM domain kinase 1
|
||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||
Summary |
There are approximately 40 known eukaryotic LIM proteins, so named for the LIM domains they contain. LIM domains are highly conserved cysteine-rich structures containing 2 zinc fingers. Although zinc fingers usually function by binding to DNA or RNA, the LIM motif probably mediates protein-protein interactions. LIM kinase-1 and LIM kinase-2 belong to a small subfamily with a unique combination of 2 N-terminal LIM motifs and a C-terminal protein kinase domain. LIMK1 is a serine/threonine kinase that regulates actin polymerization via phosphorylation and inactivation of the actin binding factor cofilin. This protein is ubiquitously expressed during development and plays a role in many cellular processes associated with cytoskeletal structure. This protein also stimulates axon growth and may play a role in brain development. LIMK1 hemizygosity is implicated in the impaired visuospatial constructive cognition of Williams syndrome. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding distinct isoforms.[provided by RefSeq, Feb 2011] |
||||||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 7:74082933-74122525 | ||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||
Band | q11.23 | ||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
|
||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 55 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 3 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
|
Gene ID
Gene Order
Not yet available
|
||||||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
Leptin pathway
|
||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Regulation of actin dynamics for phagocytic cup formation pathway
Sema4D induced cell migration and growth-cone collapse pathway
Sema4D in semaphorin signaling pathway
Sema3A PAK dependent Axon repulsion pathway
Developmental Biology pathway
Semaphorin interactions pathway
EPHB-mediated forward signaling pathway
Innate Immune System pathway
Axon guidance pathway
Immune System pathway
Fcgamma receptor (FCGR) dependent phagocytosis pathway
EPH-Ephrin signaling pathway
|
||||||||||||||||||||||||||
KEGG |
Regulation of actin cytoskeleton pathway
Axon guidance pathway
Fc gamma R-mediated phagocytosis pathway
|
||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Caspase Cascade in Apoptosis
CXCR4-mediated signaling events
RAC1 signaling pathway
CDC42 signaling events
|
||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.647035 Hs.650078 | ||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001204426 NM_002314 | ||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS5563 CCDS56491 | ||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 03210 | ||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||