Homo sapiens Gene: TCF3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-14881.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | TCF3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | transcription factor 3 (E2A immunoglobulin enhancer binding factors E12/E47) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | bHLHb21; E2A; E47; ITF1; TCF-3; VDIR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000071564 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
transcription factor 3 (E2A immunoglobulin enhancer binding factors E12/E47)
transcription factor 3 (E2A immunoglobulin enhancer binding factors E12/E47)
transcription factor 3 (E2A immunoglobulin enhancer binding factors E12/E47)
transcription factor 3 (E2A immunoglobulin enhancer binding factors E12/E47)
transcription factor 3
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a member of the E protein (class I) family of helix-loop-helix transcription factors. E proteins activate transcription by binding to regulatory E-box sequences on target genes as heterodimers or homodimers, and are inhibited by heterodimerization with inhibitor of DNA-binding (class IV) helix-loop-helix proteins. E proteins play a critical role in lymphopoiesis, and the encoded protein is required for B and T lymphocyte development. Deletion of this gene or diminished activity of the encoded protein may play a role in lymphoid malignancies. This gene is also involved in several chromosomal translocations that are associated with lymphoid malignancies including pre-B-cell acute lymphoblastic leukemia (t(1;19), with PBX1), childhood leukemia (t(19;19), with TFPT) and acute leukemia (t(12;19), with ZNF384). Alternatively spliced transcript variants encoding multiple isoforms have been observed for this gene, and a pseudogene of this gene is located on the short arm of chromosome 9. [provided by RefSeq, Sep 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 19:1609290-1652605 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | p13.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 188 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 99 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
Notch pathway
ID pathway
Wnt pathway
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REACTOME |
CDO in myogenesis pathway
Developmental Biology pathway
Myogenesis pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Notch-mediated HES/HEY network
Regulation of nuclear SMAD2/3 signaling
p38 signaling mediated by MAPKAP kinases
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | B1NYC3 Q2TB39 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 6929 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.371282 Hs.657044 Hs.741355 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001136139 NM_003200 XM_005259620 XM_006722852 XM_006722854 XM_006722855 XM_006722856 XM_006722857 XM_006722858 XM_006722859 XM_006722860 XM_006722861 XM_006722862 XM_006722863 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:11633 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 147141 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS12074 CCDS45899 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 00918 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC005321 AC006274 BC110580 EU159436 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAI10581 ACB05872 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 6929 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||