Homo sapiens Protein: PML | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-746718.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | PML | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | MYL; PP8675; RNF71; TRIM19; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000455838 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-21462 (PML) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Functions via its association with PML-nuclear bodies (PML-NBs) in a wide range of important cellular processes, including tumor suppression, transcriptional regulation, apoptosis, senescence, DNA damage response, and viral defense mechanisms. Acts as the scaffold of PML-NBs allowing other proteins to shuttle in and out, a process which is regulated by SUMO-mediated modifications and interactions. Isoform PML-4 has a multifaceted role in the regulation of apoptosis and growth suppression: activates RB1 and inhibits AKT1 via interactions with PP1 and PP2A phosphatases respectively, negatively affects the PI3K pathway by inhibiting MTOR and activating PTEN, and positively regulates p53/TP53 by acting at different levels (by promoting its acetylation and phosphorylation and by inhibiting its MDM2-dependent degradation). Isoform PML-4 also: acts as a transcriptional repressor of TBX2 during cellular senescence and the repression is dependent on a functional RBL2/E2F4 repressor complex, regulates double-strand break repair in gamma- irradiation-induced DNA damage responses via its interaction with WRN, acts as a negative regulator of telomerase by interacting with TERT, and regulates PER2 nuclear localization and circadian function. Isoform PML-6 inhibits specifically the activity of the tetrameric form of PKM. The nuclear isoforms (isoform PML-1, isoform PML-2, isoform PML-3, isoform PML-4 and isoform PML-5) in concert with SATB1 are involved in local chromatin-loop remodeling and gene expression regulation at the MHC-I locus. Isoform PML-2 is required for efficient IFN-gamma induced MHC II gene transcription via regulation of CIITA. Cytoplasmic PML is involved in the regulation of the TGF-beta signaling pathway. PML also regulates transcription activity of ELF4 and can act as an important mediator for TNF-alpha- and IFN-alpha-mediated inhibition of endothelial cell network formation and migration.Exhibits antiviral activity against both DNA and RNA viruses. The antiviral activity can involve one or several isoform(s) and can be enhanced by the permanent PML-NB-associated protein DAXX or by the recruitment of p53/TP53 within these structures. Isoform PML-4 restricts varicella zoster virus (VZV) via sequestration of virion capsids in PML-NBs thereby preventing their nuclear egress and inhibiting formation of infectious virus particles. The sumoylated isoform PML-4 restricts rabies virus by inhibiting viral mRNA and protein synthesis. The cytoplasmic isoform PML-14 can restrict herpes simplex virus-1 (HHV-1) replication by sequestering the viral E3 ubiquitin-protein ligase ICP0 in the cytoplasm. Isoform PML-6 shows restriction activity towards human cytomegalovirus (HCMV) and influenza A virus strains PR8(H1N1) and ST364(H3N2). Sumoylated isoform PML-4 and isoform PML-12 show antiviral activity against encephalomyocarditis virus (EMCV) by promoting nuclear sequestration of viral polymerase (P3D-POL) within PML NBs. Isoform PML-3 exhibits antiviral activity against poliovirus by inducing apoptosis in infected cells through the recruitment and the activation of p53/TP53 in the PML-NBs. Isoform PML-3 represses human foamy virus (HFV) transcription by complexing the HFV transactivator, bel1/tas, preventing its binding to viral DNA. PML may positively regulate infectious hepatitis C viral (HCV) production and isoform PML-2 may enhance adenovirus transcription. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus. Nucleus, nucleoplasm. Cytoplasm. Nucleus, PML body. Nucleus, nucleolus. Endoplasmic reticulum membrane {ECO:0000250}; Peripheral membrane protein {ECO:0000250}; Cytoplasmic side {ECO:0000250}. Early endosome membrane; Peripheral membrane protein; Cytoplasmic side. Note=Isoform PML-1 can shuttle between the nucleus and cytoplasm. Isoform PML-2, isoform PML-3, isoform PML-4, isoform PML-5 and isoform PML-6 are nuclear isoforms whereas isoform PML-7 and isoform PML-14 lacking the nuclear localization signal are cytoplasmic isoforms. Detected in the nucleolus after DNA damage. Acetylation at Lys-487 is essential for its nuclear localization. Within the nucleus, most of PML is expressed in the diffuse nuclear fraction of the nucleoplasm and only a small fraction is found in the matrix- associated nuclear bodies (PML-NBs). The transfer of PML from the nucleoplasm to PML-NBs depends on its phosphorylation and sumoylation. The B1 box and the RING finger are also required for the localization in PML-NBs. Also found in specific membrane structures termed mitochondria-associated membranes (MAMs) which connect the endoplasmic reticulum (ER) and the mitochondria. Sequestered in the cytoplasm by interaction with rabies virus phosphoprotein. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | Note=A chromosomal aberration involving PML may be a cause of acute promyelocytic leukemia (APL). Translocation t(15;17)(q21;q21) with RARA. The PML breakpoints (type A and type B) lie on either side of an alternatively spliced exon. {ECO:0000269PubMed:1652369, ECO:0000269PubMed:1720570}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 277 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 22 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000315
Zinc finger, B-box IPR001841 Zinc finger, RING-type IPR021978 Protein of unknown function DUF3583 |
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PFAM |
PF00643
PF13639 PF14634 PF12126 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00336
SM00184 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P29590 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-P29590 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q05835 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 5371 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.593486 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:9113 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 102578 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 00023 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AB067754 AB209411 AC013486 AC108137 AF230401 AF230402 AF230403 AF230405 AF230406 AF230407 AF230408 AF230409 AF230410 AF230411 BC000080 BC020994 BT009911 M73778 M79462 M79463 M79464 M80185 S50913 S51489 X63131 X64800 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA60125 AAA60351 AAA60352 AAA60388 AAA60390 AAB19601 AAD13865 AAG50180 AAG50181 AAG50182 AAG50184 AAG50185 AAG50186 AAG50187 AAG50188 AAG50189 AAG50190 AAH00080 AAH20994 AAP88913 BAB62809 BAD92648 CAA44841 CAA46026 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||