Homo sapiens Protein: HNRNPC | |||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-594372.3 | ||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | HNRNPC | ||||||||||||||||||||||||
Protein Name | heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C (C1/C2) | ||||||||||||||||||||||||
Synonyms | C1; C2; HNRNP; HNRPC; SNRPC; | ||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000450544 | ||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-2589 (HNRNPC) | ||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||
Function | Binds pre-mRNA and nucleates the assembly of 40S hnRNP particles. Single HNRNPC tetramers bind 230-240 nucleotides. Trimers of HNRNPC tetramers bind 700 nucleotides. May play a role in the early steps of spliceosome assembly and pre-mRNA splicing. Interacts with poly-U tracts in the 3'-UTR or 5'-UTR of mRNA and modulates the stability and the level of translation of bound mRNA molecules. {ECO:0000269PubMed:12509468, ECO:0000269PubMed:16010978, ECO:0000269PubMed:7567451, ECO:0000269PubMed:8264621}. | ||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus. Note=Component of ribonucleosomes. | ||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 173 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000504
RNA recognition motif domain IPR016137 Regulator of G protein signalling superfamily IPR017347 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C, Raly |
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PFAM |
PF00076
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||
PIRSF |
PIRSF037992
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SMART |
SM00360
SM00315 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P07910 | ||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-P07910 | ||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | G3V5X6 | ||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 3183 | ||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.735530 | ||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_004491 | ||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:5035 | ||||||||||||||||||||||||
OMIM | 164020 | ||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS45079 | ||||||||||||||||||||||||
HPRD | 01243 | ||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||
EMBL | AB209527 AK223517 AL135744 BC003394 BC007052 BC008364 BC008423 BC066932 BC089438 BC103758 BC108658 BX161480 BX247961 BX247992 CH471078 M16342 M29063 | ||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA36576 AAA52680 AAH03394 AAH07052 AAH08364 AAH08423 AAH66932 AAH89438 AAI03759 AAI08659 BAD92764 BAD97237 CAD61934 CAD62300 CAD62326 EAW66392 EAW66393 EAW66394 EAW66395 EAW66396 EAW66399 EAW66400 | ||||||||||||||||||||||||