Homo sapiens Protein: ERI1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-480100.4 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | ERI1 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | exoribonuclease 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000430190 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-6871 (ERI1) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | RNA exonuclease that binds to the 3'-end of histone mRNAs and degrades them, suggesting that it plays an essential role in histone mRNA decay after replication. A 2' and 3'-hydroxyl groups at the last nucleotide of the histone 3'-end is required for efficient degradation of RNA substrates. Also able to degrade the 3'-overhangs of short interfering RNAs (siRNAs) in vitro, suggesting a possible role as regulator of RNA interference (RNAi). Requires for binding the 5'-ACCCA-3' sequence present in stem-loop structure. Able to bind other mRNAs. Required for 5.8S rRNA 3'-end processing. Also binds to 5.8s ribosomal RNA. Binds with high affinity to the stem-loop structure of replication- dependent histone pre-mRNAs. {ECO:0000269PubMed:14536070, ECO:0000269PubMed:16912046}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cytoplasm {ECO:0000269PubMed:16912046}. Nucleus {ECO:0000269PubMed:16912046}. Nucleus, nucleolus {ECO:0000269PubMed:16912046}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 3 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR003034
SAP domain IPR006055 Exonuclease IPR012337 Ribonuclease H-like domain IPR013520 Exonuclease, RNase T/DNA polymerase III |
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PFAM |
PF02037
PF00929 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00513
SM00479 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q8IV48 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q8IV48 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | A0A024R355 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 90459 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.734074 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | XP_006716327 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:23994 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 608739 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS5972 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 11784 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AK291062 AL137679 AY310909 BC035279 CH471157 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH35279 AAQ21219 BAF83751 CAB70871 EAW65569 EAW65570 | ||||||||||||||||||||||