Homo sapiens Protein: RABGEF1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-376909.5 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | RABGEF1 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | RAB guanine nucleotide exchange factor (GEF) 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000415815 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-18687 (RABGEF1) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Rab effector protein acting as linker between gamma- adaptin, RAB4A or RAB5A. Involved in endocytic membrane fusion and membrane trafficking of recycling endosomes. Stimulates nucleotide exchange on RAB5A. Can act as a ubiquitin ligase (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cytoplasm {ECO:0000269PubMed:12505986}. Early endosome {ECO:0000269PubMed:12505986}. Recycling endosome {ECO:0000269PubMed:12505986}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 39 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR002653
Zinc finger, A20-type IPR003123 Vacuolar sorting protein 9 IPR013995 Vacuolar sorting protein 9, subgroup |
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PFAM |
PF01754
PF02204 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00259
SM00167 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q9UJ41 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q9UJ41 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | C9JDA2 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 27342 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_001273991 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:17676 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 609700 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS5535 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 13770 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AC027644 AC079588 AJ250042 AK001702 AK127790 AK223329 AK303006 BC015330 BT007107 CH471140 DQ230533 DQ230534 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH15330 AAP35771 AAQ93362 ABA64473 ABA64474 BAC87138 BAD97049 BAG50963 BAG64139 CAB57359 EAX07914 EAX07916 | ||||||||||||||||||||||