Homo sapiens Protein: KHSRP | |||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-233748.6 | ||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | KHSRP | ||||||||||||||||||||||||
Protein Name | KH-type splicing regulatory protein | ||||||||||||||||||||||||
Synonyms | FBP2; FUBP2; KSRP; | ||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000381216 | ||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-21386 (KHSRP) | ||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||
Function | Binds to the dendritic targeting element and may play a role in mRNA trafficking (By similarity). Part of a ternary complex that binds to the downstream control sequence (DCS) of the pre-mRNA. Mediates exon inclusion in transcripts that are subject to tissue-specific alternative splicing. May interact with single- stranded DNA from the far-upstream element (FUSE). May activate gene expression. Also involved in degradation of inherently unstable mRNAs that contain AU-rich elements (AREs) in their 3'- UTR, possibly by recruiting degradation machinery to ARE- containing mRNAs. {ECO:0000250, ECO:0000269PubMed:11003644, ECO:0000269PubMed:8940189, ECO:0000269PubMed:9136930}. | ||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000269PubMed:19198587}. Cytoplasm {ECO:0000269PubMed:19198587}. Note=A small proportion is also found in the cytoplasm of neuronal cell bodies and dendrites. {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Detected in neural and non-neural cell lines. | ||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 86 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 3 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR004044
K Homology domain, type 2 IPR004087 K Homology domain IPR004088 K Homology domain, type 1 IPR015096 Domain of unknown function DUF1897 |
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PFAM |
PF07650
PF00013 PF13014 PF09005 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00322
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q92945 | ||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q92945 | ||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | M0QYH3 | ||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 8570 | ||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.727344 | ||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_003676 | ||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:6316 | ||||||||||||||||||||||||
OMIM | 603445 | ||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS45936 | ||||||||||||||||||||||||
HPRD | 10350 | ||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||
EMBL | AB209662 AC011491 AC011539 AF093745 AF093747 AF093748 BC085004 U69126 U94832 | ||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAB53222 AAC50892 AAD29861 AAD29862 AAH85004 BAD92899 | ||||||||||||||||||||||||