Mus musculus Protein: Chd4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-189060.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Chd4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | chromodomain helicase DNA binding protein 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 9530019N15Rik; AA617397; BC005710; D6Ertd380e; Mi-2beta; mKIAA4075; | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000060054 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-189058 (Chd4) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Component of the histone deacetylase NuRD complex which participates in the remodeling of chromatin by deacetylating histones. {ECO:0000269PubMed:17938210}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000250}. Cytoplasm, cytoskeleton, microtubule organizing center, centrosome {ECO:0000250}. Note=Associates with centrosomes in interphase. {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 40 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 70 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:1344380 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000330
SNF2-related IPR000953 Chromo domain/shadow IPR001650 Helicase, C-terminal IPR001965 Zinc finger, PHD-type IPR006935 Helicase/UvrB domain IPR009057 Homeodomain-like IPR009071 High mobility group box domain IPR009462 Domain of unknown function DUF1086 IPR009463 Domain of unknown function DUF1087 IPR011011 Zinc finger, FYVE/PHD-type IPR012957 CHD, C-terminal 2 IPR012958 CHD, N-terminal IPR014001 Helicase, superfamily 1/2, ATP-binding domain IPR016197 Chromo domain-like IPR019787 Zinc finger, PHD-finger IPR021006 Histone deacetylase complex, subunit 2/3 IPR023780 Chromo domain IPR027417 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase |
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PFAM |
PF00176
PF00271 PF04851 PF00505 PF09011 PF06461 PF06465 PF08074 PF08073 PF00628 PF11496 PF00385 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00298
SM00490 SM00249 SM00398 SM00487 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q6PDQ2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q6PDQ2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q99JM0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 107932 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.475105 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_666091 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Chd4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS20543 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC134529 AC166162 AK034549 AK040005 AK132004 AK145532 AK148402 AK153826 BC006035 BC058578 BC071255 CH466523 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH06035 AAH58578 AAH71255 BAC28749 BAE20563 BAE20933 BAE26488 BAE28532 BAE32198 EDK99801 | ||||||||||||||||||||||||||||||||