Homo sapiens Protein: WRN | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-16094.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | WRN | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | Werner syndrome, RecQ helicase-like | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | RECQ3; RECQL2; RECQL3; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000298139 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-16092 (WRN) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Multifunctional enzyme that has both magnesium and ATP- dependent DNA-helicase activity and 3'->5' exonuclease activity towards double-stranded DNA with a 5'-overhang. Has no nuclease activity towards single-stranded DNA or blunt-ended double- stranded DNA. Binds preferentially to DNA substrates containing alternate secondary structures, such as replication forks and Holliday junctions. May play an important role in the dissociation of joint DNA molecules that can arise as products of homologous recombination, at stalled replication forks or during DNA repair. Alleviates stalling of DNA polymerases at the site of DNA lesions. Important for genomic integrity. Plays a role in the formation of DNA replication focal centers; stably associates with foci elements generating binding sites for RP-A (By similarity). Plays a role in double-strand break repair after gamma-irradiation. {ECO:0000250, ECO:0000269PubMed:11863428, ECO:0000269PubMed:17563354, ECO:0000269PubMed:18596042, ECO:0000269PubMed:19283071, ECO:0000269PubMed:19652551, ECO:0000269PubMed:21639834}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus, nucleolus. Nucleus. Nucleus, nucleoplasm. Note=Gamma-irradiation leads to its translocation from nucleoli to nucleoplasm and PML regulates the irradiation- induced WRN relocation. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | Werner syndrome (WRN) [MIM:277700]: A rare autosomal recessive progeroid syndrome characterized by the premature onset of multiple age-related disorders, including atherosclerosis, cancer, non-insulin-dependent diabetes mellitus, ocular cataracts and osteoporosis. The major cause of death, at a median age of 47, is myocardial infarction. {ECO:0000269PubMed:16673358}. Note=The disease is caused by mutations affecting the gene represented in this entry.Colorectal cancer (CRC) [MIM:114500]: A complex disease characterized by malignant lesions arising from the inner wall of the large intestine (the colon) and the rectum. Genetic alterations are often associated with progression from premalignant lesion (adenoma) to invasive adenocarcinoma. Risk factors for cancer of the colon and rectum include colon polyps, long-standing ulcerative colitis, and genetic family history. Note=The disease may be caused by mutations affecting the gene represented in this entry. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 69 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001650
Helicase, C-terminal IPR002121 HRDC domain IPR002562 3\'-5\' exonuclease domain IPR004589 DNA helicase, ATP-dependent, RecQ type IPR010997 HRDC-like IPR011545 DEAD/DEAH box helicase domain IPR012337 Ribonuclease H-like domain IPR014001 Helicase, superfamily 1/2, ATP-binding domain IPR018982 RQC domain IPR027417 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase |
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PFAM |
PF00271
PF00570 PF01612 PF00270 PF09382 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00490
SM00341 SM00474 SM00487 SM00956 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q14191 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q14191 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 7486 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.632050 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_000544 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:12791 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 604611 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS6082 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 05212 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC084736 AF091214 AF181896 AF181897 AY442327 AY818673 L76937 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAC41981 AAC63361 AAF06162 AAR05448 AAX21098 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||