Mus musculus Protein: Chd8 | |||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-158394.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Chd8 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | chromodomain helicase DNA binding protein 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 5830451P18Rik; AU015341; Duplin; HELSNF1; mKIAA1564; | ||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000087184 | ||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-158392 (Chd8) | ||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||
Function | DNA helicase that acts as a chromatin remodeling factor and regulates transcription. Acts as a transcription repressor by remodeling chromatin structure and recruiting histone H1 to target genes. Suppresses p53/TP53-mediated apoptosis by recruiting histone H1 and preventing p53/TP53 transactivation activity. Acts as a negative regulator of Wnt signaling pathway by regulating beta-catenin (CTNNB1) activity. Negatively regulates CTNNB1- targeted gene expression by being recruited specifically to the promoter regions of several CTNNB1 responsive genes. Involved in both enhancer blocking and epigenetic remodeling at chromatin boundary via its interaction with CTCF. Acts as a suppressor of STAT3 activity by suppressing the LIF-induced STAT3 transcriptional activity. Also acts as a transcription activator via its interaction with ZNF143 by participating in efficient U6 RNA polymerase III transcription. {ECO:0000269PubMed:16949368, ECO:0000269PubMed:19151705}. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000269PubMed:16949368}. Note=Localizes to the promoter regions of several CTNNB1- responsive genes. Also present at known CTCF target sites. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 10 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 28 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:1915022 | ||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000330
SNF2-related IPR000953 Chromo domain/shadow IPR001650 Helicase, C-terminal IPR006576 BRK domain IPR006935 Helicase/UvrB domain IPR011545 DNA/RNA helicase, DEAD/DEAH box type, N-terminal IPR013041 Coatomer/clathrin adaptor appendage, Ig-like subdomain IPR014001 Helicase, superfamily 1/2, ATP-binding domain IPR016197 Chromo domain-like IPR023780 Chromo domain IPR027417 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase |
||||||||||||||||||||||||||||||
PFAM |
PF00176
PF00271 PF07533 PF04851 PF00270 PF00385 |
||||||||||||||||||||||||||||||
PRINTS | |||||||||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00298
SM00490 SM00592 SM00487 |
||||||||||||||||||||||||||||||
TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q09XV5 | ||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q09XV5 | ||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 67772 | ||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.289934 | ||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_963999 | ||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Chd8 | ||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS36919 | ||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AK129393 AK160299 AY863219 DQ190419 | ||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAW56421 ABB02259 BAC98203 BAE35730 | ||||||||||||||||||||||||||||||