Homo sapiens Protein: SEMA5A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-12175.5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SEMA5A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | sema domain, seven thrombospondin repeats (type 1 and type 1-like), transmembrane domain (TM) and short cytoplasmic domain, (semaphorin) 5A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | SEMAF; semF; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000371936 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-12173 (SEMA5A) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Bifunctional axonal guidance cue regulated by sulfated proteoglycans; attractive effects result from interactions with heparan sulfate proteoglycans (HSPGs), while the inhibitory effects depend on interactions with chondroitin sulfate proteoglycans (CSPGs) (By similarity). Ligand for receptor PLXNB3. In glioma cells, SEMA5A stimulation of PLXNB3 results in the disassembly of F-actin stress fibers, disruption of focal adhesions and cellular collapse as well as inhibition of cell migration and invasion through ARHGDIA-mediated inactivation of RAC1. May promote angiogenesis by increasing endothelial cell proliferation and migration and inhibiting apoptosis. {ECO:0000250, ECO:0000269PubMed:15218527, ECO:0000269PubMed:19850054, ECO:0000269PubMed:20696765, ECO:0000269PubMed:21706053}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Membrane; Single-pass type I membrane protein. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000884
Thrombospondin, type 1 repeat IPR001627 Sema domain IPR016201 Plexin-like fold |
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PFAM |
PF00090
PF01403 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00209
SM00630 SM00423 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q13591 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q13591 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | X5DR95 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 9037 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.700222 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_003957 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:10736 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 609297 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS3875 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 10219 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC004615 AC021088 AC022446 AC027335 AC027336 AC034214 AC091906 AK293441 BC115696 CH471102 KJ534937 U52840 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAC09473 AAC14668 AAI15697 AHW56577 BAG56944 EAX08078 EAX08079 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||