Homo sapiens Gene: NHP2L1 | |||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-9368.5 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | NHP2L1 | ||||||||||||||||||
Gene Name | NHP2 non-histone chromosome protein 2-like 1 (S. cerevisiae) | ||||||||||||||||||
Synonyms | 15.5K; FA-1; FA1; NHPX; OTK27; SNRNP15-5; SNU13; SPAG12; SSFA1 | ||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000100138 | ||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
NHP2 non-histone chromosome protein 2-like 1 (S. cerevisiae)
NHP2 non-histone chromosome protein 2-like 1 (S. cerevisiae)
NHP2 non-histone chromosome protein 2-like 1 (S. cerevisiae)
NHP2 non-histone chromosome protein 2-like 1 (S. cerevisiae)
|
||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
Summary |
Originally named because of its sequence similarity to the Saccharomyces cerevisiae NHP2 (non-histone protein 2), this protein appears to be a highly conserved nuclear protein that is a component of the [U4/U6.U5] tri-snRNP. It binds to the 5' stem-loop of U4 snRNA. Two transcript variants encoding the same protein have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] Originally named because of its sequence similarity to the Saccharomyces cerevisiae NHP2 (non-histone protein 2), this protein appears to be a highly conserved nuclear protein that is a component of the [U4/U6.U5] tri-snRNP. It binds to the 5\' stem-loop of U4 snRNA. Two transcript variants encoding the same protein have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 22:41673930-41690504 | ||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||
Band | q13.2 | ||||||||||||||||||
Transcripts |
|
||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 121 experimentally validated interaction(s) in this database.
|
||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||
No orthologs found for this gene | |||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||
REACTOME |
mRNA Splicing - Major Pathway pathway
mRNA Splicing - Minor Pathway pathway
Processing of Capped Intron-Containing Pre-mRNA pathway
mRNA Splicing pathway
Gene Expression pathway
|
||||||||||||||||||
KEGG |
Spliceosome pathway
|
||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001003796 NM_005008 XM_005261620 XM_006724258 | ||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||
CCDS | CCDS14022 CCDS33653 | ||||||||||||||||||
HPRD | 03197 | ||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||