Homo sapiens Gene: HDAC9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-9049.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | HDAC9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | histone deacetylase 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | HD7; HD7b; HD9; HDAC; HDAC7; HDAC7B; HDAC9B; HDAC9FL; HDRP; MITR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000048052 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
histone deacetylase 9
histone deacetylase 9
histone deacetylase 9
histone deacetylase 9
histone deacetylase 9
histone deacetylase 9
histone deacetylase 9
histone deacetylase 9
histone deacetylase 9
histone deacetylase 9
histone deacetylase 9
histone deacetylase 9
histone deacetylase 9
histone deacetylase 9
histone deacetylase 9
histone deacetylase 9
histone deacetylase 9
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
Histones play a critical role in transcriptional regulation, cell cycle progression, and developmental events. Histone acetylation/deacetylation alters chromosome structure and affects transcription factor access to DNA. The protein encoded by this gene has sequence homology to members of the histone deacetylase family. This gene is orthologous to the Xenopus and mouse MITR genes. The MITR protein lacks the histone deacetylase catalytic domain. It represses MEF2 activity through recruitment of multicomponent corepressor complexes that include CtBP and HDACs. This encoded protein may play a role in hematopoiesis. Multiple alternatively spliced transcripts have been described for this gene but the full-length nature of some of them has not been determined. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 7:18086949-19002416 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | p21.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 117 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
No orthologs found for this gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
NOTCH1 Intracellular Domain Regulates Transcription pathway
Constitutive Signaling by NOTCH1 PEST Domain Mutants pathway
Constitutive Signaling by NOTCH1 HD+PEST Domain Mutants pathway
Signaling by NOTCH1 t(7;9)(NOTCH1:M1580_K2555) Translocation Mutant pathway
Signaling by NOTCH1 in Cancer pathway
FBXW7 Mutants and NOTCH1 in Cancer pathway
Signal Transduction pathway
Signaling by NOTCH1 PEST Domain Mutants in Cancer pathway
Signaling by NOTCH1 HD+PEST Domain Mutants in Cancer pathway
Signaling by NOTCH pathway
Signaling by NOTCH1 pathway
Signaling by NOTCH1 HD Domain Mutants in Cancer pathway
Disease pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH |
TGF-beta signaling pathway
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PID NCI |
Signaling events mediated by HDAC Class II
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.196054 Hs.640515 Hs.734148 Hs.734495 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001204144 NM_001204145 NM_001204146 NM_001204147 NM_001204148 NM_014707 NM_058176 NM_178423 NM_178425 XM_006715802 XM_006715803 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS47553 CCDS47554 CCDS47555 CCDS47557 CCDS56465 CCDS56466 CCDS56467 CCDS56468 CCDS75565 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 05944 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||