Homo sapiens Gene: KDM5D | |||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-354.6 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | KDM5D | ||||||||||||||||||
Gene Name | lysine (K)-specific demethylase 5D | ||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000012817 | ||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
lysine (K)-specific demethylase 5D
lysine (K)-specific demethylase 5D
lysine (K)-specific demethylase 5D
lysine (K)-specific demethylase 5D
lysine (K)-specific demethylase 5D
lysine (K)-specific demethylase 5D
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Protein Structure | |||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a protein containing zinc finger domains. A short peptide derived from this protein is a minor histocompatibility antigen which can lead to graft rejection of male donor cells in a female recipient. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Apr 2009] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome Y:19703865-19744939 | ||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||
Band | q11.223 | ||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 7 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||
No orthologs found for this gene | |||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||
REACTOME |
HDMs demethylate histones pathway
Chromatin organization pathway
Chromatin modifying enzymes pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
UniGene | Hs.630488 Hs.80358 | ||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001146705 NM_001146706 NM_004653 XM_005262563 | ||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||
CCDS | CCDS14794 CCDS55554 CCDS55555 | ||||||||||||||||||
HPRD | 02464 | ||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||