Homo sapiens Gene: RARB | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-22486.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | RARB | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | retinoic acid receptor, beta | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | HAP; MCOPS12; NR1B2; RRB2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000077092 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
retinoic acid receptor, beta
retinoic acid receptor, beta
retinoic acid receptor, beta
retinoic acid receptor, beta
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes retinoic acid receptor beta, a member of the thyroid-steroid hormone receptor superfamily of nuclear transcriptional regulators. This receptor localizes to the cytoplasm and to subnuclear compartments. It binds retinoic acid, the biologically active form of vitamin A which mediates cellular signalling in embryonic morphogenesis, cell growth and differentiation. It is thought that this protein limits growth of many cell types by regulating gene expression. The gene was first identified in a hepatocellular carcinoma where it flanks a hepatitis B virus integration site. The gene expresses at least two transcript variants; one additional transcript has been described, but its full length nature has not been determined. [provided by RefSeq, Jul 2008] This gene encodes retinoic acid receptor beta, a member of the thyroid-steroid hormone receptor superfamily of nuclear transcriptional regulators. This receptor localizes to the cytoplasm and to subnuclear compartments. It binds retinoic acid, the biologically active form of vitamin A which mediates cellular signalling in embryonic morphogenesis, cell growth and differentiation. It is thought that this protein limits growth of many cell types by regulating gene expression. The gene was first identified in a hepatocellular carcinoma where it flanks a hepatitis B virus integration site. Alternate promoter usage and differential splicing result in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Mar 2014] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 3:25174332-25597932 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | p24.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 37 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 8 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Nuclear Receptor transcription pathway pathway
Generic Transcription Pathway pathway
Gene Expression pathway
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KEGG |
Non-small cell lung cancer pathway
Small cell lung cancer pathway
Pathways in cancer pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.654490 Hs.735252 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_000965 NM_001290217 NM_001290266 NM_001290276 NM_001290300 NM_016152 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS2642 CCDS46775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 07183 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||