Homo sapiens Gene: POLR1D | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-19480.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | POLR1D | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | polymerase (RNA) I polypeptide D, 16kDa | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000186184 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
polymerase (RNA) I polypeptide D, 16kDa
polymerase (RNA) I polypeptide D, 16kDa
polymerase (RNA) I polypeptide D, 16kDa
polymerase (RNA) I polypeptide D, 16kDa
polymerase (RNA) I polypeptide D, 16kDa
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene is a component of the RNA polymerase I and RNA polymerase III complexes, which function in the synthesis of ribosomal RNA precursors and small RNAs, respectively. Mutations in this gene are a cause of Treacher Collins syndrome (TCS), a craniofacial development disorder. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Apr 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 13:27620743-27667422 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q12.2 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 27 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH |
TNFalpha pathway
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REACTOME |
RNA Polymerase III Abortive And Retractive Initiation pathway
RNA Polymerase III Transcription Termination pathway
RNA Polymerase III Chain Elongation pathway
RNA Polymerase III Transcription Initiation From Type 3 Promoter pathway
RNA Polymerase III Transcription Initiation From Type 2 Promoter pathway
RNA Polymerase III Transcription Initiation From Type 1 Promoter pathway
RNA Polymerase I Transcription Termination pathway
RNA Polymerase I Chain Elongation pathway
RNA Polymerase I Promoter Escape pathway
RNA Polymerase I Transcription Initiation pathway
RNA Polymerase I Transcription pathway
RNA Polymerase III Transcription Initiation pathway
Innate Immune System pathway
Epigenetic regulation of gene expression pathway
RNA Polymerase I Promoter Clearance pathway
NoRC negatively regulates rRNA expression pathway
Immune System pathway
RNA Polymerase III Transcription pathway
RNA Polymerase I, RNA Polymerase III, and Mitochondrial Transcription pathway
Cytosolic sensors of pathogen-associated DNA pathway
Gene Expression pathway
Negative epigenetic regulation of rRNA expression pathway
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KEGG |
Pyrimidine metabolism pathway
Purine metabolism pathway
RNA polymerase pathway
Cytosolic DNA-sensing pathway pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.507584 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001206559 NM_015972 NM_152705 XM_005266412 XM_005266414 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS73555 CCDS9324 CCDS9325 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 17877 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||