Homo sapiens Gene: FIP1L1 | |||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-18445.6 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | FIP1L1 | ||||||||||||||||||
Gene Name | FIP1 like 1 (S. cerevisiae) | ||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000145216 | ||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
FIP1 like 1 (S. cerevisiae)
FIP1 like 1 (S. cerevisiae)
FIP1 like 1 (S. cerevisiae)
FIP1 like 1 (S. cerevisiae)
FIP1 like 1 (S. cerevisiae)
FIP1 like 1 (S. cerevisiae)
FIP1 like 1 (S. cerevisiae)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a subunit of the CPSF (cleavage and polyadenylation specificity factor) complex that polyadenylates the 3' end of mRNA precursors. This gene, the homolog of yeast Fip1 (factor interacting with PAP), binds to U-rich sequences of pre-mRNA and stimulates poly(A) polymerase activity. Its N-terminus contains a PAP-binding site and its C-terminus an RNA-binding domain. An interstitial chromosomal deletion on 4q12 creates an in-frame fusion of human genes FIP1L1 and PDGFRA (platelet-derived growth factor receptor, alpha). The FIP1L1-PDGFRA fusion gene encodes a constitutively activated tyrosine kinase that joins the first 233 amino acids of FIP1L1 to the last 523 amino acids of PDGFRA. This gene fusion and chromosomal deletion is the cause of some forms of idiopathic hypereosinophilic syndrome (HES). This syndrome, recently reclassified as chronic eosinophilic leukemia (CEL), is responsive to treatment with tyrosine kinase inhibitors. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding distinct isoforms. [provided by RefSeq, Oct 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 4:53377643-54295272 | ||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||
Band | q12 | ||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 33 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||
No orthologs found for this gene | |||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||
KEGG |
mRNA surveillance pathway pathway
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INOH | |||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
UniGene | Hs.624245 | ||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001134937 NM_001134938 NM_030917 XM_005265770 XM_005265771 XM_005265780 XM_005265781 | ||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||
CCDS | CCDS3491 CCDS47055 CCDS47056 | ||||||||||||||||||
HPRD | 09646 | ||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||