Homo sapiens Gene: SYNJ1 | |||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-1770.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SYNJ1 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | synaptojanin 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | INPP5G; PARK20 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000159082 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
synaptojanin 1
synaptojanin 1
synaptojanin 1
synaptojanin 1
synaptojanin 1
synaptojanin 1
synaptojanin 1
synaptojanin 1
synaptojanin 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a phosphoinositide phosphatase that regulates levels of membrane phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate. As such, expression of this enzyme may affect synaptic transmission and membrane trafficking. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Sep 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 21:32628759-32728048 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q22.11 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 27 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 3 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Synthesis of PIPs at the plasma membrane pathway
Synthesis of IP2, IP, and Ins in the cytosol pathway
Synthesis of IP3 and IP4 in the cytosol pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
PI Metabolism pathway
Phospholipid metabolism pathway
Inositol phosphate metabolism pathway
Metabolism pathway
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KEGG |
Inositol phosphate metabolism pathway
Phosphatidylinositol signaling system pathway
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INOH |
Inositol phosphate metabolism pathway
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PID NCI |
Internalization of ErbB1
EPHB forward signaling
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.473632 | ||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001160302 NM_001160306 NM_003895 NM_203446 XM_005261080 XM_006724058 XM_006724059 XM_006724062 XM_006724063 | ||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS33539 CCDS33540 CCDS54483 | ||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 09182 | ||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||