Homo sapiens Gene: PIP5K1C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-17648.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | PIP5K1C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase, type I, gamma | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | LCCS3; PIP5K-GAMMA; PIP5K1-gamma; PIP5Kgamma | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000186111 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase, type I, gamma
phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase, type I, gamma
phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase, type I, gamma
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This locus encodes a type I phosphatidylinositol 4-phosphate 5-kinase. The encoded protein catalyzes phosphorylation of phosphatidylinositol 4-phosphate, producing phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate. This enzyme is found at synapses and has been found to play roles in endocytosis and cell migration. Mutations at this locus have been associated with lethal congenital contractural syndrome. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been described.[provided by RefSeq, Sep 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 19:3630183-3700479 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | p13.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 17 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 3 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
BCR pathway
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REACTOME |
Synthesis of PIPs at the plasma membrane pathway
SEMA3A-Plexin repulsion signaling by inhibiting Integrin adhesion pathway
Developmental Biology pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
Semaphorin interactions pathway
Axon guidance pathway
PI Metabolism pathway
Phospholipid metabolism pathway
Metabolism pathway
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KEGG |
Regulation of actin cytoskeleton pathway
Inositol phosphate metabolism pathway
Phosphatidylinositol signaling system pathway
Focal adhesion pathway
Fc gamma R-mediated phagocytosis pathway
Endocytosis pathway
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INOH |
Inositol phosphate metabolism pathway
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PID NCI |
E-cadherin signaling in the nascent adherens junction
Nectin adhesion pathway
RAC1 signaling pathway
Stabilization and expansion of the E-cadherin adherens junction
Arf6 trafficking events
N-cadherin signaling events
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.282177 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001195733 NM_001300849 NM_012398 XM_005259523 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS32872 CCDS56074 CCDS74257 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 05834 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||