Homo sapiens Gene: SNX1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-16207.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SNX1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | sorting nexin 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | HsT17379; VPS5 | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000028528 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
sorting nexin 1
sorting nexin 1
sorting nexin 1
sorting nexin 1
sorting nexin 1
sorting nexin 1
sorting nexin 1
sorting nexin 1
sorting nexin 1
sorting nexin 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a member of the sorting nexin family. Members of this family contain a phox (PX) domain, which is a phosphoinositide binding domain, and are involved in intracellular trafficking. This endosomal protein regulates the cell-surface expression of epidermal growth factor receptor. This protein also has a role in sorting protease-activated receptor-1 from early endosomes to lysosomes. This protein may form oligomeric complexes with family members. This gene results in three transcript variants encoding distinct isoforms. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 15:64094123-64146090 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q22.31 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 58 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH |
TGF_beta_Receptor pathway
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REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI |
PAR1-mediated thrombin signaling events
Posttranslational regulation of adherens junction stability and dissassembly
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.188634 Hs.695096 Hs.703547 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001242933 NM_003099 NM_148955 XM_005254610 XM_005254611 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS32266 CCDS32268 CCDS58371 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 03171 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||