Homo sapiens Gene: IL7R | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-16161.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | IL7R | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | interleukin 7 receptor | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | CD127; CDW127; IL-7R-alpha; IL7RA; ILRA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000168685 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
interleukin 7 receptor
interleukin 7 receptor
interleukin 7 receptor
interleukin 7 receptor
interleukin 7 receptor
interleukin 7 receptor
interleukin 7 receptor
interleukin 7 receptor
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
Differentiation of Type 3 innate lymphoid cells (ILC3) to IL7R(+) ILC1 is reversible whereas IL7R(+) ILC1 can differentiate to ILC3 in the presence of IL2, IL23A, and IL1B dependent on the transcription factor RORC, and this process is enhanced in the presence of retinoic acid.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene is a receptor for interleukine 7 (IL7). The function of this receptor requires the interleukin 2 receptor, gamma chain (IL2RG), which is a common gamma chain shared by the receptors of various cytokines, including interleukine 2, 4, 7, 9, and 15. This protein has been shown to play a critical role in the V(D)J recombination during lymphocyte development. This protein is also found to control the accessibility of the TCR gamma locus by STAT5 and histone acetylation. Knockout studies in mice suggested that blocking apoptosis is an essential function of this protein during differentiation and activation of T lymphocytes. The functional defects in this protein may be associated with the pathogenesis of the severe combined immunodeficiency (SCID). [provided by RefSeq, Jul 2008] The protein encoded by this gene is a receptor for interleukine 7 (IL7). The function of this receptor requires the interleukin 2 receptor, gamma chain (IL2RG), which is a common gamma chain shared by the receptors of various cytokines, including interleukine 2, 4, 7, 9, and 15. This protein has been shown to play a critical role in the V(D)J recombination during lymphocyte development. This protein is also found to control the accessibility of the TCR gamma locus by STAT5 and histone acetylation. Knockout studies in mice suggested that blocking apoptosis is an essential function of this protein during differentiation and activation of T lymphocytes. The functional defects in this protein may be associated with the pathogenesis of the severe combined immunodeficiency (SCID). Alternatively spliced transcript variants have been found for this gene. [provided by RefSeq, May 2014] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 5:35852695-35879603 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | p13.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 127 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 6 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
KitReceptor pathway
IL-7 pathway
TSLP pathway
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REACTOME |
Interleukin-7 signaling pathway
Cytokine Signaling in Immune system pathway
Immune System pathway
Signaling by Interleukins pathway
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KEGG |
Hematopoietic cell lineage pathway
Cytokine-cytokine receptor interaction pathway
Jak-STAT signaling pathway pathway
Primary immunodeficiency pathway
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INOH |
IL-7 signaling pathway
JAK STAT pathway and regulation pathway
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PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P16871 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | B8YG18 D6RCR9 D6RDM4 D6RG28 D6RGV2 D9N160 H0Y8G3 H0YA41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 3575 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.591742 Hs.619102 Hs.715147 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_002185 XM_005248300 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:6024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 146661 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS3911 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC112204 AF043123 AF043124 AF043125 AF043126 AF043127 AF043128 AF043129 AK301220 AK315251 AY449709 BC020717 BC067537 BC067538 BC067539 BC067540 BC069999 FJ529208 M29696 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA59157 AAC83204 AAH20717 AAH67537 AAH67538 AAH67539 AAH67540 AAH69999 AAR08908 ACL80333 BAG37673 BAG62793 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 3575 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||