Homo sapiens Gene: TPM1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-15400.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | TPM1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | tropomyosin 1 (alpha) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | C15orf13; CMD1Y; CMH3; HTM-alpha; LVNC9; TMSA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000140416 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
tropomyosin 1 (alpha)
tropomyosin 1 (alpha)
tropomyosin 1 (alpha)
tropomyosin 1 (alpha)
tropomyosin 1 (alpha)
tropomyosin 1 (alpha)
tropomyosin 1 (alpha)
tropomyosin 1 (alpha)
tropomyosin 1 (alpha)
tropomyosin 1 (alpha)
tropomyosin 1 (alpha)
tropomyosin 1 (alpha)
tropomyosin 1 (alpha)
tropomyosin 1 (alpha)
tropomyosin 1 (alpha)
tropomyosin 1 (alpha)
tropomyosin 1 (alpha)
tropomyosin 1 (alpha)
tropomyosin 1 (alpha)
tropomyosin 1 (alpha)
tropomyosin 1 (alpha)
tropomyosin 1 (alpha)
tropomyosin 1 (alpha)
tropomyosin 1 (alpha)
tropomyosin 1 (alpha)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene is a member of the tropomyosin family of highly conserved, widely distributed actin-binding proteins involved in the contractile system of striated and smooth muscles and the cytoskeleton of non-muscle cells. Tropomyosin is composed of two alpha-helical chains arranged as a coiled-coil. It is polymerized end to end along the two grooves of actin filaments and provides stability to the filaments. The encoded protein is one type of alpha helical chain that forms the predominant tropomyosin of striated muscle, where it also functions in association with the troponin complex to regulate the calcium-dependent interaction of actin and myosin during muscle contraction. In smooth muscle and non-muscle cells, alternatively spliced transcript variants encoding a range of isoforms have been described. Mutations in this gene are associated with type 3 familial hypertrophic cardiomyopathy. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 15:63042632-63071915 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q22.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 67 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 7 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Smooth Muscle Contraction pathway
Striated Muscle Contraction pathway
Muscle contraction pathway
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KEGG |
Hypertrophic cardiomyopathy (HCM) pathway
Cardiac muscle contraction pathway
Dilated cardiomyopathy pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.635569 Hs.713685 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_000366 NM_001018004 NM_001018005 NM_001018006 NM_001018007 NM_001018008 NM_001018020 NM_001301289 XM_005254637 XM_005254644 XM_005254646 XM_005254648 XM_005254650 XM_005254651 XM_005254652 XM_005254653 XM_006720668 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS10181 CCDS32262 CCDS32263 CCDS32264 CCDS45273 CCDS58368 CCDS58369 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 01839 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||