Homo sapiens Gene: SCARF1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-15121.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SCARF1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | scavenger receptor class F, member 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | SREC; SREC-I; SREC1 | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000074660 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
scavenger receptor class F, member 1
scavenger receptor class F, member 1
scavenger receptor class F, member 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||
Summary |
SCARF1 mediates host defence against Cryptococcus neoformans and Candida albicans through cytokine production and is required for macrophage binding to C. neoformans to control the infection in mice.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene is a scavenger receptor that is expressed in endothelial cells and mediates the binding and degradation of acetylated low density lipoprotein (Ac-LDL). Transcription factors ZNF444/EZF-2 and SP1 are found to be responsible for the regulation of this gene. Five alternatively spliced transcript variants encoding distinct isoforms have been described. [provided by RefSeq, Jul 2008] The protein encoded by this gene is a scavenger receptor that is expressed in endothelial cells. It regulates the uptake of chemically modified low density lipoproteins, including acetylated low density lipoprotein (Ac-LDL), and it may be involved in atherogenesis. This gene is regulated by the transcription factors ZNF444/EZF-2 and SP1. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Apr 2013] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 17:1633858-1645747 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | p13.3 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 2 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Scavenging by Class F Receptors pathway
Binding and Uptake of Ligands by Scavenger Receptors pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.647430 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_003693 NM_145350 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS11007 CCDS45564 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 06386 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||