Homo sapiens Gene: CHD4 | |||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-14532.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | CHD4 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | chromodomain helicase DNA binding protein 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | CHD-4; Mi-2b; Mi2-BETA | ||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000111642 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
chromodomain helicase DNA binding protein 4
chromodomain helicase DNA binding protein 4
chromodomain helicase DNA binding protein 4
chromodomain helicase DNA binding protein 4
chromodomain helicase DNA binding protein 4
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
The product of this gene belongs to the SNF2/RAD54 helicase family. It represents the main component of the nucleosome remodeling and deacetylase complex and plays an important role in epigenetic transcriptional repression. Patients with dermatomyositis develop antibodies against this protein. [provided by RefSeq, Jul 2008] The product of this gene belongs to the SNF2/RAD54 helicase family. It represents the main component of the nucleosome remodeling and deacetylase complex and plays an important role in epigenetic transcriptional repression. Patients with dermatomyositis develop antibodies against this protein. Somatic mutations in this gene are associated with serous endometrial tumors. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Jul 2014] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 12:6570083-6607476 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||
Band | p13.31 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 115 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 27 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
RNA Polymerase I Transcription Initiation pathway
RNA Polymerase I Transcription pathway
RNA Polymerase I Promoter Clearance pathway
HDACs deacetylate histones pathway
Chromatin organization pathway
Chromatin modifying enzymes pathway
RNA Polymerase I, RNA Polymerase III, and Mitochondrial Transcription pathway
Gene Expression pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Signaling events mediated by HDAC Class I
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q14839 | ||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 1108 | ||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.162233 Hs.605320 | ||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | XM_006718958 NM_001273 NM_001297553 XM_005253668 XM_006718959 XM_006718960 XM_006718961 | ||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:1919 | ||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 603277 | ||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS8552 | ||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 04472 | ||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC006064 BC038596 X86691 | ||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH38596 CAA60384 | ||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 1108 | ||||||||||||||||||||||||||||||