Homo sapiens Gene: GRIK1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-1374.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | GRIK1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | glutamate receptor, ionotropic, kainate 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | EAA3; EEA3; GLR5; GluK1; GLUR5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000171189 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
glutamate receptor, ionotropic, kainate 1
glutamate receptor, ionotropic, kainate 1
glutamate receptor, ionotropic, kainate 1
glutamate receptor, ionotropic, kainate 1
glutamate receptor, ionotropic, kainate 1
glutamate receptor, ionotropic, kainate 1
glutamate receptor, ionotropic, kainate 1
glutamate receptor, ionotropic, kainate 1
glutamate receptor, ionotropic, kainate 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
Glutamate receptors are the predominant excitatory neurotransmitter receptors in the mammalian brain and are activated in a variety of normal neurophysiologic processes. This gene product belongs to the kainate family of glutamate receptors, which are composed of four subunits and function as ligand-activated ion channels. The subunit encoded by this gene is subject to RNA editing (CAG->CGG; Q->R) within the second transmembrane domain, which is thought to alter the properties of ion flow. Alternative splicing, resulting in transcript variants encoding different isoforms, has been noted for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] Glutamate receptors are the predominant excitatory neurotransmitter receptors in the mammalian brain and are activated in a variety of normal neurophysiologic processes. This gene product belongs to the kainate family of glutamate receptors, which are composed of four subunits and function as ligand-activated ion channels. The subunit encoded by this gene is subject to RNA editing (CAG->CGG; Q->R) within the second transmembrane domain, which is thought to alter the properties of ion flow. Alternative splicing, resulting in transcript variants encoding different isoforms, has been noted for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 21:29536933-29940033 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q21.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 9 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Activation of Na-permeable Kainate Receptors pathway
Neuronal System pathway
Ionotropic activity of Kainate Receptors pathway
Activation of Kainate Receptors upon glutamate binding pathway
Transmission across Chemical Synapses pathway
Activation of Ca-permeable Kainate Receptor pathway
Neurotransmitter Receptor Binding And Downstream Transmission In The Postsynaptic Cell pathway
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KEGG |
Neuroactive ligand-receptor interaction pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | E7ENK3 Q71UA3 Q9UNN1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 2897 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.664641 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | XM_006723991 NM_000830 NM_175611 XM_005260942 XM_005260943 XM_005260944 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:4579 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 138245 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS33530 CCDS42913 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 00693 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AF107257 AF107259 AP000091 AP000236 AP000237 AP000238 AP000239 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAD03059 AAD04931 BAA97452 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 2897 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||