Homo sapiens Gene: HIRA | |||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-1317.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | HIRA | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | HIR histone cell cycle regulation defective homolog A (S. cerevisiae) | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | DGCR1; TUP1; TUPLE1 | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000100084 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
HIR histone cell cycle regulation defective homolog A (S. cerevisiae)
HIR histone cell cycle regulation defective homolog A (S. cerevisiae)
HIR histone cell cycle regulation defective homolog A (S. cerevisiae)
|
||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a histone chaperone that preferentially places the variant histone H3.3 in nucleosomes. Orthologs of this gene in yeast, flies, and plants are necessary for the formation of transcriptionally silent heterochomatin. This gene plays an important role in the formation of the senescence-associated heterochromatin foci. These foci likely mediate the irreversible cell cycle changes that occur in senescent cells. It is considered the primary candidate gene in some haploinsufficiency syndromes such as DiGeorge syndrome, and insufficient production of the gene may disrupt normal embryonic development. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 22:19330698-19447450 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q11.21 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
|
||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 35 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 7 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
|
Gene ID
Gene Order
Not yet available
|
||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Cellular responses to stress pathway
Formation of Senescence-Associated Heterochromatin Foci (SAHF) pathway
DNA Damage/Telomere Stress Induced Senescence pathway
Cellular Senescence pathway
|
||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | P54198 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | F5H4M2 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 7290 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.474206 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_003325 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:4916 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 600237 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS13759 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AC000068 AC000079 AC000085 AC000092 BC032721 BC039835 CR456503 X75296 X77633 X81844 X89887 X91501 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH32721 AAH39835 CAA53044 CAA54721 CAA57436 CAA61979 CAA62800 CAG30389 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 7290 | ||||||||||||||||||||||