Homo sapiens Gene: KDM5A | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-11318.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | KDM5A | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | lysine (K)-specific demethylase 5A | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | RBBP-2; RBBP2; RBP2 | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000073614 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
lysine (K)-specific demethylase 5A
lysine (K)-specific demethylase 5A
lysine (K)-specific demethylase 5A
lysine (K)-specific demethylase 5A
lysine (K)-specific demethylase 5A
lysine (K)-specific demethylase 5A
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene is a ubiquitously expressed nuclear protein. It binds directly, with several other proteins, to retinoblastoma protein which regulates cell proliferation. This protein also interacts with rhombotin-2 which functions distinctly in erythropoiesis and in T-cell leukemogenesis. Rhombotin-2 is thought to either directly affect the activity of the encoded protein or may indirectly modulate the functions of the retinoblastoma protein by binding to this protein. [provided by RefSeq, Mar 2010] This gene encodes a member of the Jumonji, AT-rich interactive domain 1 (JARID1) histone demethylase protein family. The encoded protein plays a role in gene regulation through the histone code by specifically demethylating lysine 4 of histone H3. The encoded protein interacts with many other proteins, including retinoblastoma protein, and is implicated in the transcriptional regulation of Hox genes and cytokines. This gene may play a role in tumor progression. [provided by RefSeq, Aug 2013] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 12:280129-389454 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | p13.33 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 35 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
HDMs demethylate histones pathway
Chromatin organization pathway
Chromatin modifying enzymes pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.618774 Hs.76272 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001042603 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS41736 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 08915 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||