Homo sapiens Gene: SLC10A1 | |||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-10519.6 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | SLC10A1 | ||||||||||||||||||
Gene Name | solute carrier family 10 (sodium/bile acid cotransporter family), member 1 | ||||||||||||||||||
Synonyms | NTCP | ||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000100652 | ||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
solute carrier family 10 (sodium/bile acid cotransporter family), member 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene belongs to the sodium/bile acid cotransporter family, which are integral membrane glycoproteins that participate in the enterohepatic circulation of bile acids. Two homologous transporters are involved in the reabsorption of bile acids; the ileal sodium/bile acid cotransporter with an apical cell localization that absorbs bile acids from the intestinal lumen, bile duct and kidney, and the liver-specific sodium/bile acid cotransporter, represented by this protein, that is found in the basolateral membranes of hepatocytes. Bile acids are the catabolic product of cholesterol metabolism, hence this protein is important for cholesterol homeostasis. [provided by RefSeq, Oct 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 14:69775417-69797289 | ||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||
Band | q24.1 | ||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 2 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||
REACTOME |
Recycling of bile acids and salts pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
Bile acid and bile salt metabolism pathway
Metabolism pathway
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KEGG |
Bile secretion pathway
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INOH | |||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | Q14973 | ||||||||||||||||||
TrEMBL | Q9UK36 | ||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | 6554 | ||||||||||||||||||
UniGene | Hs.952 | ||||||||||||||||||
RefSeq | NM_003049 | ||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:10905 | ||||||||||||||||||
OMIM | 182396 | ||||||||||||||||||
CCDS | CCDS9797 | ||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | AF184235 AY544127 BC069799 BC069822 BC074724 BC126298 BC136355 CH471061 L21893 | ||||||||||||||||||
GenPept | AAA36381 AAD56541 AAH69799 AAH69822 AAH74724 AAI26299 AAI36356 AAT11158 EAW81011 | ||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 6554 | ||||||||||||||||||