Bos taurus Gene: CLOCK | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-642395.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | CLOCK | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | Uncharacterized protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000044044 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
clock homolog (mouse)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene plays a central role in the regulation of circadian rhythms. The protein encodes a transcription factor of the basic helix-loop-helix (bHLH) family and contains DNA binding histone acetyltransferase activity. The encoded protein forms a heterodimer with ARNTL (BMAL1) that binds E-box enhancer elements upstream of Period (PER1, PER2, PER3) and Cryptochrome (CRY1, CRY2) genes and activates transcription of these genes. PER and CRY proteins heterodimerize and repress their own transcription by interacting in a feedback loop with CLOCK/ARNTL complexes. Polymorphisms in this gene may be associated with behavioral changes in certain populations and with obesity and metabolic syndrome. [provided by RefSeq, Feb 2014] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 6:72574278-72633079 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 47 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
PPARA activates gene expression pathway
Regulation of lipid metabolism by Peroxisome proliferator-activated receptor alpha (PPARalpha) pathway
Fatty acid, triacylglycerol, and ketone body metabolism pathway
RORA activates circadian gene expression pathway
BMAL1:CLOCK,NPAS2 activates circadian gene expression pathway
REV-ERBA represses gene expression pathway
Circadian Clock pathway
HATs acetylate histones pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
Chromatin organization pathway
Chromatin modifying enzymes pathway
Metabolism pathway
Bmal1:Clock,Npas2 activates circadian gene expression pathway
Circadian Clock pathway
Mus musculus biological processes pathway
Chromatin organization pathway
Fatty acid, triacylglycerol, and ketone body metabolism pathway
Circadian Clock pathway
REV-ERBA represses gene expression pathway
RORA activates circadian gene expression pathway
HATs acetylate histones pathway
Metabolism pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
Regulation of lipid metabolism by Peroxisome proliferator-activated receptor alpha (PPARalpha) pathway
Chromatin modifying enzymes pathway
PPARA activates gene expression pathway
BMAL1:CLOCK,NPAS2 activates circadian gene expression pathway
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KEGG |
Circadian rhythm pathway
Circadian rhythm pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Circadian rhythm pathway
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | F1MLT7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 100300400 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | XM_002688257 XM_005207980 XM_005207981 XM_005207982 XM_005207983 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:2082 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | DAAA02017731 DAAA02017732 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 100300400 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||