Bos taurus Gene: SATB1 | |||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-640809.3 | ||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SATB1 | ||||||||||||||||||||||||
Gene Name | DNA-binding protein SATB1 | ||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000021158 | ||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
DNA-binding protein SATB1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000182568:
This gene encodes a matrix protein which binds nuclear matrix and scaffold-associating DNAs through a unique nuclear architecture. The protein recruits chromatin-remodeling factors in order to regulate chromatin structure and gene expression. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Sep 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 1:157169740-157261755 | ||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 24 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Apoptotic cleavage of cellular proteins pathway
Apoptotic execution phase pathway
Apoptosis pathway
Apoptosis pathway
Apoptotic cleavage of cellular proteins pathway
Apoptotic execution phase pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Caspase Cascade in Apoptosis
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | A7MB41 | ||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 516952 | ||||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.44470 | ||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001102040 XM_005202140 | ||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||
EMBL | BC151323 DAAA02003773 DAAA02003774 DAAA02003775 | ||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAI51324 | ||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 516952 | ||||||||||||||||||||||||