Homo sapiens Gene: TET2 | |||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-32690.6 | ||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | TET2 | ||||||||||||||||||||||||
Gene Name | tet methylcytosine dioxygenase 2 | ||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000168769 | ||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
tet methylcytosine dioxygenase 2
tet methylcytosine dioxygenase 2
tet methylcytosine dioxygenase 2
tet methylcytosine dioxygenase 2
tet methylcytosine dioxygenase 2
tet methylcytosine dioxygenase 2
tet methylcytosine dioxygenase 2
tet methylcytosine dioxygenase 2
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||||
Summary |
TET2 selectively mediates active repression of IL6 transcription via NFKBIZ and HDAC2 during inflammation resolution in innate myeloid cells, including dendritic cells and macrophages.
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InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Mus musculus] Tet2 selectively mediates active repression of Il6 transcription via Nfkbiz and Hdac2 during inflammation resolution in innate myeloid cells, including dendritic cells and macrophages.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene is a methylcytosine dioxygenase that catalyzes the conversion of methylcytosine to 5-hydroxymethylcytosine. The encoded protein is involved in myelopoiesis, and defects in this gene have been associated with several myeloproliferative disorders. Two variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Mar 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 4:105145875-105279816 | ||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||
Band | q24 | ||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 9 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 7 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
TET1,2,3 and TDG demethylate DNA pathway
Epigenetic regulation of gene expression pathway
Gene Expression pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.367639 Hs.706276 Hs.740935 | ||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001127208 NM_017628 XM_005263082 XM_006714243 | ||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS3666 CCDS47120 | ||||||||||||||||||||||||
HPRD | 07876 | ||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||