Mus musculus Gene: Prpf8 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-200019.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Prpf8 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | pre-mRNA processing factor 8 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000020850 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
pre-mRNA processing factor 8
pre-mRNA processing factor 8
pre-mRNA processing factor 8
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000174231:
Pre-mRNA splicing occurs in 2 sequential transesterification steps. The protein encoded by this gene is a component of both U2- and U12-dependent spliceosomes, and found to be essential for the catalytic step II in pre-mRNA splicing process. It contains several WD repeats, which function in protein-protein interactions. This protein has a sequence similarity to yeast Prp8 protein. This gene is a candidate gene for autosomal dominant retinitis pigmentosa. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 11:75486816-75509449 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | B5 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 61 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 89 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
mRNA Splicing pathway
mRNA Splicing - Minor Pathway pathway
Gene Expression pathway
mRNA Splicing - Major Pathway pathway
Processing of Capped Intron-Containing Pre-mRNA pathway
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KEGG |
Spliceosome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
mRNA Splicing - Major Pathway pathway
mRNA Splicing - Minor Pathway pathway
Processing of Capped Intron-Containing Pre-mRNA pathway
mRNA Splicing pathway
Gene Expression pathway
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KEGG |
Spliceosome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q99PV0 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | B7ZC27 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 192159 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.3757 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_138659 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS25048 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:2179381 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Prpf8 | ||||||||||||||||||||||
EMBL | AB047391 AK041017 AL591496 BC034648 BC054103 BC093481 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH34648 AAH54103 AAH93481 BAB32671 BAC30783 CAI35387 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 192159 | ||||||||||||||||||||||