Mus musculus Gene: Ercc4 | |||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-133610.6 | ||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Ercc4 | ||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 4 | ||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | AI606920; Xpf | ||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000022545 | ||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 4
excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 4
excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 4
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000175595:
The protein encoded by this gene forms a complex with ERCC1 and is involved in the 5' incision made during nucleotide excision repair. This complex is a structure specific DNA repair endonuclease that interacts with EME1. Defects in this gene are a cause of xeroderma pigmentosum complementation group F (XP-F), or xeroderma pigmentosum VI (XP6).[provided by RefSeq, Mar 2009] The protein encoded by this gene forms a complex with ERCC1 and is involved in the 5\' incision made during nucleotide excision repair. This complex is a structure specific DNA repair endonuclease that interacts with EME1. Defects in this gene are a cause of xeroderma pigmentosum complementation group F (XP-F), or xeroderma pigmentosum VI (XP6).[provided by RefSeq, Mar 2009] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 16:13109684-13150617 | ||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||
Band | A1 | ||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 24 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Transcription-coupled NER (TC-NER) pathway
Formation of transcription-coupled NER (TC-NER) repair complex pathway
Dual incision reaction in GG-NER pathway
Global Genomic NER (GG-NER) pathway
Formation of incision complex in GG-NER pathway
Nucleotide Excision Repair pathway
DNA Repair pathway
Dual incision reaction in TC-NER pathway
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KEGG |
Nucleotide excision repair pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Formation of transcription-coupled NER (TC-NER) repair complex pathway
Dual incision reaction in TC-NER pathway
Transcription-coupled NER (TC-NER) pathway
Dual incision reaction in GG-NER pathway
Formation of incision complex in GG-NER pathway
Global Genomic NER (GG-NER) pathway
Nucleotide Excision Repair pathway
DNA Repair pathway
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KEGG |
Nucleotide excision repair pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.287837 | ||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_015769 | ||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS37256 | ||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||